Rika Furude y su grupo de amigos viven en el pequeño pueblo de montaña de Hinamizawa; en junio de 1983, dan la bienvenida a sus filas a Keiichi Maebara, un estudiante transferido, convirtiéndolo en el único chico de su grupo. Después de la escuela, se divierten jugando y pasando cada día viviendo sus vidas al máximo. A pesar de esta rutina aparentemente normal, Keiichi empieza a notar un comportamiento extraño en sus amigos, que parecen ocultarle los oscuros secretos del pueblo.
En otro lugar, cierta persona observa cómo se desarrollan estos sucesos cada vez más inquietantes y recuerda todas las veces que ésta, y otras historias similares, han tenido lugar. Usando ese conocimiento, esta persona decide arreglar estos mundos rotos. Sin embargo, cuando ciertas variables cambian, el individuo se enfrenta a una horrible realidad: no tiene ni idea de qué esperar ni de cómo detener la inminente tragedia.
