"¡Un corazón creyente es tu magia!" - estas fueron las palabras que el ídolo de Atsuko "Akko" Kagari, la renombrada bruja Shiny Chariot, le dijo durante una actuación mágica hace años. Desde entonces, Akko ha vivido de acuerdo con estas palabras y aspiraba a ser una bruja como Shiny Chariot, una que puede hacer sonreír a la gente. Por lo tanto, incluso sus antecedentes no mágicos no impiden que se inscriba en Luna Nova Magical Academy.
Sin embargo, cuando una emocionada Akko finalmente se dirige a su nueva escuela, el viaje no es nada tranquilo. Después de su peligroso viaje, se hace amiga de la tímida Lotte Yansson y de la sarcástica Sucy Manbavaran. Para su mayor deleite, también descubre la varita de Chariot, la Varita Brillante, que ella toma como propia. Desafortunadamente, su tiempo en Luna Nova será más desafiante de lo que Akko podría creer. Ella se niega rotundamente a permanecer inferior al resto de sus compañeros, especialmente a su autoproclamada rival, la bella y dotada Diana Cavendish, por lo que confía en su determinación de compensar su conducta imprudente y su ineptitud en la magia.
En un momento en que la magia está en declive, Little Witch Academia sigue las escapadas mágicas de Akko y sus amigos mientras aprenden el verdadero significado de ser una bruja.
