Diez años después de enfrentarse a la derrota en la Cuarta Guerra del Santo Grial, Waver Velvet, ahora Lord El Melloi II, imparte clases en la Torre del Reloj, el centro de educación para los magos. Sin embargo, su nueva condición de "Lord" viene con una advertencia: obedecer las órdenes de Reines, la hermana menor del difunto Kayneth El Melloi, hasta que tenga la edad suficiente para gobernar la Casa de El Melloi.
Waver, junto con su misterioso aprendiz Gray, se encarga de una serie de casos asignados por Reines y la Asociación de Magos. Cada caso resulta ser más complejo que el anterior, ¿podría haber más en la Torre del Reloj de lo que parece, y qué secretos esconde Reines?
