En el año Universal Century 0079, la humanidad vive en colonias espaciales llamadas Sides. Side 3, del Principado de Zeon, ha declarado la guerra a la Federación de la Tierra. Después de la lucha inicial, hay un estancamiento que dura ocho meses. Sin embargo esta tregua cesa cuando Amuro Ray tropieza con Gundam, el arma secreta de la Federación de la Tierra. Ahora Amuro y la tripulación de la Base White deben deben hacer frente a Zeon para terminar con la guerra.