La historia comienza con un enfrentamiento entre dos héroes rivales, ZET y ALPHAS, y luego recorre sus orígenes: Jin Kanzaki, un joven con la capacidad de transformarse en un ser sobrehumano conocido como ZET, y Kouga Amagi, un joven con un fuerte sentido de la justicia que utiliza la tecnología para luchar como ALPHAS.
Los destinos de estos dos hombres y de los que les rodean se entrelazan mientras luchan por proteger a la humanidad y destruir a las monstruosas abominaciones conocidas como Players.
